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# bioinformatics

探索包含 bioinformatics 主题特性的所有开源仓库、扩展插件与智能体组件。

BioDSH
sagirimo

生信智能桌面工具,面向临床医生与湿实验室科研人员,提供一键安装包、可扩展技能商店与离线使用能力,无需复杂配置即可开展常规生信分析,降低生信工具使用门槛。

支持从学术论文PDF、公众号文章、屏幕截图中自动解析生信图表,生成可复用的R/Python绘图配方,使用中自动扩充配方库,可直接调用生成对应图表,简化生信绘图操作。

它是面向生物信息学分析的轻量级路由插件,可自动对接主流生信工具链,简化分析流程配置,实现生信任务的智能路由调度,开箱即用降低生信分析部署门槛。

dsh-bioinf
gsh150801

作为面向大模型推理框架的生物信息学专用插件,可无缝调用框架核心推理能力,覆盖序列比对、功能注释等生信分析场景,内置标准化分析模板与参数预设,降低生信工具使用门槛,开箱即用。

dsh-pubmed
aiyacharley

整合PubMed、Europe PMC、PubTator3、Semantic Scholar等25个工具,支持实体感知检索、跨库统一搜索,可获取对应文献的元数据、全文等信息,满足生物医学领域文献检索需求

dsh-wisp-science-lab
wisp-science

Wisp Science实验室专用插件,支持只读查看本地实验课题快照,基于现有实验证据提供可落地的优化建议,无需修改原始实验数据即可快速评估课题进展与调整方向。

的轻量级生信校验插件,内置多维度生信数据校验规则,支持常见测序、分析结果文件的自动化一致性核验,部署简单可直接集成到dsh工作流使用。

dsh-omicos
omicverse

持久Python内核运行OmicOS生信分析任务,内置能力目录搜索功能快速匹配所需分析模块,搭配账户标签页统一管理账号信息,无需重复配置环境即可便捷开展分析工作。

Wisp科学实验室插件,支持只读取览本地Wisp科学课题的实验快照进展,基于已有实验证据给出专业优化建议,无需改动实验数据即可跟进项目状态、获取实验指导。

dsh-pdb
cloud-pkumdl

DAG的代理驱动工作流编排工具,用于蛋白质结合体设计,支持工作流计划可视化与人机回环审核,可高效打通各类无GUI蛋白质设计工具的使用链路。

dsh-bioinfo
Paraso42

整合AF2-Multimer、ESMFold、AutoDock Vina等主流生信工具,预设蛋白质结构预测、分子互作分析、自由能计算等常用工作流,无需手动配置环境即可一键启动常规生信分析任务。

支持代理驱动单元格,内联图形可反馈并重跑;自动记录清单溯源,保存环境快照,让实验全流程可复现。内置9个生物信息学模块,覆盖常用分析操作。